MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-9

Total Repeats: 806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017402	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017402	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017402	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017402	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017402	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017402	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017402	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017402	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017402	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017402	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017402	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017402	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017402	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017402	CT	3	6	675	680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017402	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017402	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017402	AAT	2	6	718	723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017402	TCT	2	6	745	750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017402	T	6	6	750	755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017402	TTA	2	6	817	822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017402	AAT	2	6	856	861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017402	TTA	2	6	905	910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017402	AGG	2	6	932	937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017402	ATTA	2	8	945	952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017402	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017402	ATT	2	6	1049	1054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017402	GAA	2	6	1162	1167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017402	AGT	2	6	1231	1236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017402	TAA	2	6	1242	1247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017402	GAG	2	6	1249	1254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017402	ATT	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017402	AGA	2	6	1318	1323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
33	NC_017402	AGA	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
34	NC_017402	AGA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
35	NC_017402	GCA	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827868
36	NC_017402	AGCA	2	8	1425	1432	50 %	0 %	25 %	25 %	387827868
37	NC_017402	ATT	2	6	1531	1536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827868
38	NC_017402	AGG	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827868
39	NC_017402	TTGC	2	8	1613	1620	0 %	50 %	25 %	25 %	387827868
40	NC_017402	GTTC	2	8	1678	1685	0 %	50 %	25 %	25 %	387827868
41	NC_017402	GA	3	6	1740	1745	50 %	0 %	50 %	0 %	387827868
42	NC_017402	ATTAA	2	10	1781	1790	60 %	40 %	0 %	0 %	387827868
43	NC_017402	A	6	6	1792	1797	100 %	0 %	0 %	0 %	387827868
44	NC_017402	TTC	3	9	1810	1818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827868
45	NC_017402	AGA	2	6	1855	1860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827868
46	NC_017402	AGA	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827869
47	NC_017402	A	6	6	2050	2055	100 %	0 %	0 %	0 %	387827869
48	NC_017402	TAG	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827869
49	NC_017402	ACA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827869
50	NC_017402	TGG	3	9	2280	2288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827869
51	NC_017402	TGGCA	2	10	2331	2340	20 %	20 %	40 %	20 %	387827869
52	NC_017402	AAATGG	2	12	2391	2402	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387827869
53	NC_017402	TGCT	2	8	2531	2538	0 %	50 %	25 %	25 %	387827869
54	NC_017402	AATTA	2	10	2569	2578	60 %	40 %	0 %	0 %	387827869
55	NC_017402	TGA	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827870
56	NC_017402	ACAAG	2	10	2683	2692	60 %	0 %	20 %	20 %	387827870
57	NC_017402	TGA	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827870
58	NC_017402	AGA	2	6	2892	2897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827870
59	NC_017402	TA	3	6	2967	2972	50 %	50 %	0 %	0 %	387827870
60	NC_017402	CTGATA	2	12	2987	2998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387827870
61	NC_017402	ATGT	2	8	3017	3024	25 %	50 %	25 %	0 %	387827870
62	NC_017402	TAG	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827870
63	NC_017402	GTAT	2	8	3042	3049	25 %	50 %	25 %	0 %	387827870
64	NC_017402	ATAA	2	8	3124	3131	75 %	25 %	0 %	0 %	387827870
65	NC_017402	TTA	2	6	3140	3145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827870
66	NC_017402	TGG	3	9	3153	3161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827870
67	NC_017402	CCA	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827870
68	NC_017402	TAAT	2	8	3173	3180	50 %	50 %	0 %	0 %	387827870
69	NC_017402	CT	3	6	3190	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	387827870
70	NC_017402	CAAT	2	8	3206	3213	50 %	25 %	0 %	25 %	387827870
71	NC_017402	TGG	2	6	3336	3341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827870
72	NC_017402	AAGAG	2	10	3409	3418	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017402	T	6	6	3507	3512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017402	ATC	2	6	3556	3561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017402	TGG	2	6	3653	3658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017402	GAT	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017402	AAT	2	6	3732	3737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017402	TAG	2	6	3751	3756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017402	TAA	2	6	3797	3802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017402	TTTA	2	8	3895	3902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017402	GTAA	2	8	3933	3940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017402	GGA	2	6	3957	3962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017402	ATT	2	6	3974	3979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
84	NC_017402	TGA	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
85	NC_017402	ATT	2	6	3988	3993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
86	NC_017402	TAT	2	6	4037	4042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
87	NC_017402	CCA	2	6	4094	4099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827871
88	NC_017402	ACA	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827871
89	NC_017402	ATT	2	6	4207	4212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
90	NC_017402	AT	3	6	4277	4282	50 %	50 %	0 %	0 %	387827871
91	NC_017402	TAA	3	9	4292	4300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827871
92	NC_017402	TC	3	6	4312	4317	0 %	50 %	0 %	50 %	387827871
93	NC_017402	AGT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
94	NC_017402	TTA	2	6	4354	4359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
95	NC_017402	A	6	6	4403	4408	100 %	0 %	0 %	0 %	387827871
96	NC_017402	ACT	2	6	4439	4444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827871
97	NC_017402	AGA	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827871
98	NC_017402	GTG	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827871
99	NC_017402	A	6	6	4513	4518	100 %	0 %	0 %	0 %	387827871
100	NC_017402	CGA	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827871
101	NC_017402	GAT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
102	NC_017402	CAG	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827871
103	NC_017402	AGT	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827871
104	NC_017402	TAA	2	6	4691	4696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827871
105	NC_017402	AGA	2	6	4700	4705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827871
106	NC_017402	TTA	2	6	4771	4776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827871
107	NC_017402	AGTA	2	8	4788	4795	50 %	25 %	25 %	0 %	387827871
108	NC_017402	CTAC	2	8	4800	4807	25 %	25 %	0 %	50 %	387827871
109	NC_017402	TCAT	2	8	4847	4854	25 %	50 %	0 %	25 %	387827871
110	NC_017402	GGT	2	6	4872	4877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827871
111	NC_017402	CTA	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827871
112	NC_017402	A	7	7	4890	4896	100 %	0 %	0 %	0 %	387827871
113	NC_017402	GAA	3	9	4987	4995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827872
114	NC_017402	TA	3	6	5136	5141	50 %	50 %	0 %	0 %	387827872
115	NC_017402	TTAC	2	8	5155	5162	25 %	50 %	0 %	25 %	387827872
116	NC_017402	GTT	2	6	5200	5205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827872
117	NC_017402	GAATTT	2	12	5209	5220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387827872
118	NC_017402	A	6	6	5230	5235	100 %	0 %	0 %	0 %	387827872
119	NC_017402	TGAACT	2	12	5247	5258	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387827872
120	NC_017402	ATT	2	6	5261	5266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827872
121	NC_017402	TAG	2	6	5271	5276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827872
122	NC_017402	GAA	2	6	5287	5292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827872
123	NC_017402	GGC	2	6	5293	5298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387827872
124	NC_017402	G	6	6	5301	5306	0 %	0 %	100 %	0 %	387827872
125	NC_017402	TG	3	6	5386	5391	0 %	50 %	50 %	0 %	387827872
126	NC_017402	AATG	2	8	5402	5409	50 %	25 %	25 %	0 %	387827872
127	NC_017402	TGT	2	6	5495	5500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827873
128	NC_017402	TTC	2	6	5516	5521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827873
129	NC_017402	AG	3	6	5527	5532	50 %	0 %	50 %	0 %	387827873
130	NC_017402	TTA	2	6	5569	5574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827873
131	NC_017402	TGG	2	6	5818	5823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827874
132	NC_017402	TAG	2	6	5899	5904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827874
133	NC_017402	AT	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	387827874
134	NC_017402	AAT	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827874
135	NC_017402	TA	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	387827874
136	NC_017402	CTA	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827874
137	NC_017402	AAGT	2	8	6067	6074	50 %	25 %	25 %	0 %	387827874
138	NC_017402	GTA	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827874
139	NC_017402	GCA	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827874
140	NC_017402	TTG	2	6	6108	6113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827874
141	NC_017402	AAT	2	6	6235	6240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827875
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288	NC_017402	AACTT	2	10	12684	12693	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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403	NC_017402	TAA	3	9	17090	17098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_017402	A	7	7	17097	17103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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